PCR實驗室通常采用非單向流送風方式，所謂非單向流，指氣流流線方向不平行，風速也不一致。PCR實驗室一般采用上送下回式。上部送風依靠送風口進入房間，下部回風依靠每個房間的對稱分布的排風柱下部的排風口排風。
新風從室外進入處理機組，經過粗效、中效、亞、表冷(熱)段、噴淋段(加濕)幾個處理過程，然后進入潔凈室
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PCR實驗室功能分區
PCR負壓實驗室按照工作流程劃分為4個主要區域：1試劑準備區、2標本制備區、3產物擴增區、4產物分析區，以及相關緩沖區及走廊，詳見圖1。根據相關實驗室建設規范要求，PCR各區域必須相互獨立，每個單獨實驗區設有專門的緩沖室給工作人員更衣。設置傳遞窗，雙門互為連鎖，并設置紫外線燈，避免污染，試劑、樣本嚴格按單向流線傳遞。
3.1.3排風系統
各區域排風經過排風機組內部三級過濾（初、中、亞過濾器）后排至屋頂；排風系統設計時已考慮室內排風與生物安全柜排風進行互鎖控制，保證實驗室的負壓不變。
3.2 負壓設計（平戰結合）
PCR實驗室設計成負壓，能夠讓整個PCR實驗過程中試劑和樣本免受污染，減少對工作人員和環境的污染。具體氣體流向為：公共走廊——PCR走廊——各實驗區域緩沖間——實驗區域。新冠疫情期間，氣流按照單向負壓壓力級別，降低試劑樣本污染環境。疫情過后，PCR實驗室通過排風量調節使這實驗區域達到正壓，不但滿足疫情期間臨時性使用要求，也能滿足正常時期PCR實驗室需求，達到平戰轉換使用原則。
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