6.1 運行系統的管理
制定出系統的管理規程并嚴格執行，整體調控系統、運行系統和監測系統必須設專人管理。
6.2 維護性管理
整個潔凈設備系統需設專門維修人員進行精心維護和修理，制定出有效可行的措施。（1）通風罩應每周清潔處理1次。（2）通風機的狀況應每周檢測。（3）過濾設備定期檢查、維修和保養，以保證過濾設備的正常運轉與良好性能。初、中效過濾器每隔30天檢測一次，并用洗滌劑清洗，備用一套，以備清洗時使用。根據使用情況，初、中效過濾器應該每隔3～6個月更換一次，在更換前過濾器應是干的。在未裝初、中效過濾器前設備不能運行，這樣才能延長價格較貴的過濾器的使用壽命。同時，潔凈室周圍環境的清潔、空調送風過濾系統的正常運行和嚴格的使用管理規范，也是延長空氣過濾器使用壽命的關鍵。（4）風淋室運行2年后，應檢查進出門的密封性。
6.3 機房的管理
專人管理，控制凈化空調設備的運行和停止。清掃并保持機房衛生。對凈化手術室運行情況進行記錄。
根據《潔凈廠房設計規范》車間的墻體和吊頂bi須采用不產塵、不積塵表面平滑的材料施工，并且不能在車間中存在死角。采用凈化廠房施工彩板，基板頂板采用寶鋼0.4的鋼板，芯材密度達到14kg/m3，鋁材采用華聯鋁型材，為提高凈化間的使用壽命，并達到美觀大方的效果，所有鋁型材進行電泳處理。
關于車間的地面 ，地面采用溶劑型環氧樹脂，強度C20以上，表面密實，無起沙、空鼓、裂縫。顏色艷麗，防靜電性能恒jiu不變，可承受中等以荷，耐高溫。在滿足使用的基礎上，可以起到裝飾的作用，耐磨、耐洗刷、防塵、防滑、性能優良，顏色和光澤均勻一致。
通風空氣凈化設備 潔凈廠房設計，按照規范要求，設計一送回風系統。機房設在廠房頂側（根據實地情況，可采用
單元式凈化系統的，不用設機房），各送回風循環風管在技術夾層內與空調機組連接成系統。送回風管道采用you質鍍鋅鋼板，經風閥軟連接。鍍鋅鋼板風管現場制作。
照明 潔凈區應采用吸頂式凈化燈具，非潔凈區采用普通熒光燈。設計各房間內照明，紫外燈獨立控制，并均由電氣控制箱控制，再由總配電柜集中控制；室內照明均采用密閉照明燈組；插座盤均采用嵌入式；室內無明線敷設。
層流傳遞窗主要用于潔凈區和潔凈區之間或潔凈區和非潔凈區之間的物品的傳遞(主要應用于生物制藥行業)，其原理是通過層流自凈的方式把打開門后在放置產品過程中帶入傳遞窗的灰塵。層流傳遞窗的風速一般在0.3-0.8米/秒，通過層流過濾的形式，使傳遞窗內部形成一個百級的凈化環境，從而使在潔凈區內打開門后不會形成污染。
風淋式傳遞窗主要用于潔凈區和潔凈區之間或潔凈區和非潔凈區之間的小件物品的傳遞，通過吹淋方式利用通過凈化后的空氣高速把產品上表面的灰塵吹掉，從而避免把產品表面的灰塵帶入潔凈區。在層流自凈的過程中，往往會通過時間繼電器控制傳遞窗的門鎖，如果沒有到達自凈的時候，傳遞窗的門是打不開的;風淋傳遞窗的內部因為其結構和風速決定了其凈化程度只能達到千級的凈化效果，而層流傳遞窗的一個基本要求，較少也要達到千級，較高可達到十級甚至一級的效果。
在制藥行業新版GMP對傳遞窗的管理要求中，因為許多生產車間都是百級甚至十級的區域，為了避免傳遞物對潔凈室的影響，新版GMP對傳遞窗的要求比以往提高了許多，所以以往的風淋傳遞窗的作用就不符合要求，必須要用層流傳遞窗以避免污染其生產環境，新版GMP傳遞窗在于嚴格按照自凈時間，沒有達到自凈時間無法取出物品，從而達到GMP管理要求。所以，選用此兩款傳遞窗較重要的個問題就是取決于到底是用在什么地方!
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