樣本間交叉污染

主要是在采（取）樣的過程中，由于取樣工具之間的交叉造成污染；或者在核酸提取的過程中，由于移液器、離心管等使用不當導致的污染。

PCR試劑的污染

主要是在PCR試劑配制過程中，由于移液器、容器、陰性對照及其它試劑被核酸模板或陽性對照污染。

質粒的污染

在實驗室操作中經常會用到陽性參考品，這些陽性參考品大多數是由某些質粒制作而成，質粒在單位容積內濃度高，不小心使用極易造成污染。

PCR擴增產物污染

這是PCR反應中常見的污染問題。因為PCR產物拷貝量大，遠遠高于PCR檢測數個拷貝的極限，所以極微量的PCR產物污染，就可造成假陽性結果。還有一種容易忽視，可能造成PCR產物污染的形式是氣溶膠污染，在空氣與液體面摩擦時就可形成氣溶膠，據計算一個氣溶膠顆粒可含4.8萬拷貝，因而由其造成的污染是一個值得特別重視的問題。

（1）滲漏密閉性：將n個PCR管加入半量墨汁，蓋好蓋子后放入水中，浸泡30min，沒有墨汁滲出為合格。

（2）離心密閉性：將n個PCR管加入半量純水，放入離心機，1000 rpm，30min，管蓋未崩開未漏液為合格。

（3）熱密閉性：將n個PCR管加入半量純水，蓋好蓋子稱重后放入PCR儀，設置一個常用的PCR程序，程序運行完畢后，再進行稱重，PCR管未變形，管蓋未崩開未漏液，前后重量未變化為合格。

（4）冷密閉性：將n個PCR管加入半量純水，放入-20℃冰箱，24h，離心管未變形，管蓋未崩開未漏液為合格。

（5）污染物質檢：將n個PCR管加入半量陰性純水，蓋好蓋子渦旋1 min后靜置5min，作為模板進行擴增，qPCR無擴增為合格。

（6）抑制物質檢：將n個PCR管分別加入弱陽性質控物,室溫靜置5min，然后進行提取;RNA核酸，DNA核酸，室溫靜置5min，作為模板進行擴增，qPCR擴增未被抑制為合格。

（7）空白熒光通透性：對于qPCR,需要考察PCR管是否有非特異性熒光信號，將n個空PCR管，蓋好蓋子后放入PCR儀，設置一個常用的PCR程序，程序運行完畢后，qPCR無擴增為合格。

（8）陽性熒光通透性：對于qPCR,還需要考察PCR管是否會抑制熒光的通透性，將n個含弱陽性樣品和擴增試劑的PCR管，與確認無熒光干擾的PCR管，蓋好蓋子后放入PCR儀一同擴增，設置一個常用的PCR程序，程序運行完畢后，qPCR擴增未被抑制為合格。

   GMP生物制藥潔凈車間的特點同傳統的潔凈車間是存在一定的區別的，傳統的凈化車間注重的是潔凈室內的潔凈度，而在生物制藥中卻不盡要保證空氣中的潔凈度，更要考慮到空氣中懸浮粒子的化學性、物理性、生命性和性，這些是無法被從潔凈度檢測中發現。所以生物制藥必須嚴格按照GMP管理體系，如此才能的消除可能潛在的污染源，提高藥品的成品率。

   生物制藥車間的特點在于多個方面的表現：

   GMP生物制藥車間相比一般的無塵室，其設備以及生產工藝更為復雜，當然費用也會更高，而且生物制藥不僅對凈化車間的潔凈度和級別有著非常高的要求，同時對空氣中的細菌和顆粒物等污染源的控制有著更高的要求。對潔凈區中的塵埃粒子及微生物污染進行控制的房間，必須具備防止該區域內污染物的引入、產生和滯留的功能。

   生物制藥在整個生產流程中是存在潛在的生物危害的，主要表現在危險，或者是死細菌、死細胞以及成分代謝對人體可能會產生生物致毒、致敏等生物學反應，所以生物制藥對于的管理體系必須嚴格執行，對于生產人員必須有著明確嚴謹的規范要求，所以對生產人員的素質要求也是有著苛刻的規定。

   如此復雜的設計、如此嚴謹的規定，才能保證藥品生產的成品率，生物制藥潔凈廠房對于設計、施工一級內部的設備設施的制造和安裝都有著明確且嚴格的要求，因為不管是生產用到材料、包裝材料的質量以及人凈和物凈設施控制程序都可能會對藥品生產質量產生巨大的影響。