1、試劑儲存和準備區。貯存試劑和用于標本制備的消耗品等材料應當直接運送至試劑貯存和準備區，不能經過擴增檢測區，試劑盒中的陽性對照品及質控品不應當保存在該區，應當保存在標本制備區；

2、標本制備區。由于在樣本混合、核酸純化過程中可能會發生氣溶膠所致的污染，可通過在本區內設立正壓條件，避免從鄰近區進入本區的氣溶膠污染。為避免樣本間的交叉污染，加入待測核酸后，必須蓋好含反應混合液的反應管。對具有潛在危險性的材料，必須在生物安全柜內開蓋，并有明確的樣本處理和滅活程序；

3、擴增區。為避免氣溶膠所致的污染，應當盡量減少在本區內的走動。必須注意的是，所有經過檢測的反應管不得在此區域打開；

4、擴增產物分析區。本區是的擴增產物污染來源，因此必須注意避免通過本區的物品及工作服將擴增產物帶出。廢液及用過的吸頭必須收集至HCl中，不能在實驗室內傾倒，浸泡后再放到垃圾袋中按程序處理。由于本區有可能會用到某些可致基因突變和有毒物質如化乙錠、酰胺、甲醛或性核素等，故應當注意實驗人員的安全防護；

5、注意物品流向，依次為：試劑準備區、樣本制備區、擴增區、產物分析區，不可逆行；

6、試劑準備區、樣本制備區和擴增區內的實驗用品應，并設置不同的標識、顏色等予以區分。

需要注意以下問題：

實驗室使用的基因擴增儀，熒光定量PCR儀都是高精度儀器。一旦儀器出現一些溫度或者檢測上的小偏差，則很可能對實驗結果產生較大的影響。因此，學會日常保養和維護是尤為重要的。

1、儀器安置

儀器應安放在濕度較低、灰塵較少并遠離水源和熱源的地方，無腐蝕性氣體或強磁場干擾。

環境溫度建議在18~35℃之間。儀器之間應保持50cm 以上距離，降低儀器之間的影響。

2、樣品臺、熱蓋定期清潔

用95%乙醇配合棉簽、無塵布等工具，清潔樣品臺。之后運行PCR儀，設定保持溫度為50℃，約5~10min，讓殘余液體揮發去除。另外，熱蓋也應該用酒精或純水定期清洗，確保熱蓋清潔，溫控性能良好。對于熒光定量PCR，清潔樣品臺和熱蓋的同時，去除灰塵等雜物，保證光路清潔，降低信號干擾。

3. 使用前預熱

老款的PCR儀的性能比不上新款儀器，使用前需要進行預熱，不僅對儀器維護有好處，還能節約實驗時間。新款的儀器升溫快，但還是建議能在進行實驗前預熱2min，這樣可以有效延長儀器的使用壽命。

4. 定期運行維護

1.PCR儀器需要定期檢測，視制冷方式而定一般半年至少一次。

2.PCR反應的要求溫度與實際分布的反應溫度是不一致的，當檢測發現各孔平均溫度差偏離設置溫度大于1～2℃時，可以運用溫度修正法糾正PCR實際反應溫度差。

3.PCR反應過程的關鍵是升、降溫過程的時間控制，要求越短越好，當PCR儀的降溫過程超過60s，就應該檢查儀器的制冷系統，對風冷制冷的PCR儀要較地清理反應底座的灰塵；對其他制冷系統應檢查相關的制冷部件。

4.一般情況如能采用溫度修正法糾正儀器的溫度時，不要輕易打開或調整儀器的電子控制部件，必要時要請人員修理或利用儀器電子線路詳細圖紙進行維修。

      傳統凈化工程存在三個不足：

      1）傳統的凈化工程其細菌飄塵只是被過濾膜截留下不能殺滅，在適宜溫濕度下極易自身繁殖，造成污染發霉等現象，繼續使用極易發生二次污染；

      2）由于我國大氣污染嚴重，過濾膜極易被阻塞，需頻繁更換，使用成本高且較繁雜；

      3）依托過濾膜雖然解決了潔凈度問題，但潔凈室內的有毒有害氣體異味以及凈化系統自身產生的化學污染無法得到解決。

      具體解決方案有：

     （1）采用靜電滅菌凈化柜來殺滅細菌，消毒并去除飄塵。

      靜電滅菌凈化柜的工作原理：靜電滅菌凈化柜中的電場，采用圓孔針狀、蜂巢棒狀的雙區靜電場；雙區指的是極化區和極塵區。當通風管道中送出的空氣在通過雙區靜電場時，空氣中的細菌、飄塵等污染物首先被靜電場極化 (即充上負電荷)，因細菌的胞囊其本身是帶負電荷的，在通過靜電極化區時被再一次充上很高能量的負電荷。帶負電荷的細菌、病毒等污染物通過系統進入正電場的集塵區時，即刻被集塵區的正集塵板強烈的吸集，在正電極的作用下，要在瞬間快速釋放其胞囊中的負電荷能量時，胞囊即刻被擊碎而，其滅菌率達到99.99%，從而達到滅菌消毒的目的。同時靜電場對空氣中的飄塵有強烈的吸集與凝并作用，其除塵率達96%。這就有效的保護了過濾膜，增加其使用壽命 2—3倍，而電場用金屬材料制作，可方便的卸下，清洗后反復使用，減少了系統的使用成本。

    （2） 應用納米鈦炭網與光觸媒技術去除有害氣體以及異味。

     在凈化系統的送回風管道中（或在靜電凈化柜中）安裝應用納米鈦炭濾網，并使用光觸媒技術，可以非常有效的去除降解有毒有害氣體及氣味。從而解決了潔凈工程不能去除有毒有害氣體及氣味的難題。