1、試劑儲存和準備區。貯存試劑和用于標本制備的消耗品等材料應當直接運送至試劑貯存和準備區，不能經過擴增檢測區，試劑盒中的陽性對照品及質控品不應當保存在該區，應當保存在標本制備區；
2、標本制備區。由于在樣本混合、核酸純化過程中可能會發生氣溶膠所致的污染，可通過在本區內設立正壓條件，避免從鄰近區進入本區的氣溶膠污染。為避免樣本間的交叉污染，加入待測核酸后，必須蓋好含反應混合液的反應管。對具有潛在危險性的材料，必須在生物安全柜內開蓋，并有明確的樣本處理和滅活程序；
3、擴增區。為避免氣溶膠所致的污染，應當盡量減少在本區內的走動。必須注意的是，所有經過檢測的反應管不得在此區域打開；
4、擴增產物分析區。本區是的擴增產物污染來源，因此必須注意避免通過本區的物品及工作服將擴增產物帶出。廢液及用過的吸頭必須收集至HCl中，不能在實驗室內傾倒，浸泡后再放到垃圾袋中按程序處理。由于本區有可能會用到某些可致基因突變和有毒物質如化乙錠、酰胺、甲醛或性核素等，故應當注意實驗人員的安全防護；
5、注意物品流向，依次為：試劑準備區、樣本制備區、擴增區、產物分析區，不可逆行；
6、試劑準備區、樣本制備區和擴增區內的實驗用品應，并設置不同的標識、顏色等予以區分。
PCR實驗室中的氣溶膠污染來源于兩個過程：樣本制備過程和PCR擴增過程。
在樣本制備過程中，樣本液體面與空氣摩擦就可形成氣溶膠，在操作時比較劇烈地搖動反應管、開蓋時、吸樣時及加樣器的反復吸樣都可能形成氣溶膠而污染；PCR擴增過程可以引起實驗室中擴增產物的累積，通常一次典型的PCR擴增可以產生109拷貝的靶序列，如果氣溶膠化，甚至的氣溶膠都會含有106拷貝的擴增產物。
如果不加以控制，在短期內累積的氣溶膠化擴增產物就會污染實驗室中的試劑、儀器設備和通風系統，造成嚴重的實驗室污染，導致檢驗樣本出現假陽性結果，使臨床做出錯誤的判斷和決策，進而引發后續一系列的事故和恐慌。
輔料的質檢通常是在新一批的輔料到實驗室后統一做一次或者定期（半年或1年）做，因此質檢就包含了驗貨和質檢2個部分。由于輔料的質檢沒有一個統一的標準，一般由各實驗室自行制定，可簡可繁，這里提出一些方法供大家參考和批評指正。
1.外包裝檢查：外包裝應完整無損無污，標識清楚，檢查品名、品牌，貨號，規格、生產日期，有效期、保存條件等信息。
2.內包裝檢查：內包裝物品應與外包裝標識一致，檢查是否有破損，泄漏，內容物是否齊全，是否有相應的使用說明書等。
3.性能質檢：檢測試劑耗材是否與其性能一致，比如吸頭的準確性和氣密性等
4.污染物質檢：檢測試劑耗材是否被常規檢測項目的待檢物污染，這種污染可能是物品生產環節，也可能是運輸或實驗室的保存過程中被污染。
5.抑制物質檢：檢測試劑耗材中是否存在PCR反應的抑制物，比如核酸酶。
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