PCR實驗室中的氣溶膠污染來源于兩個過程：樣本制備過程和PCR擴增過程。
在樣本制備過程中，樣本液體面與空氣摩擦就可形成氣溶膠，在操作時比較劇烈地搖動反應管、開蓋時、吸樣時及加樣器的反復吸樣都可能形成氣溶膠而污染；PCR擴增過程可以引起實驗室中擴增產物的累積，通常一次典型的PCR擴增可以產生109拷貝的靶序列，如果氣溶膠化，甚至的氣溶膠都會含有106拷貝的擴增產物。
如果不加以控制，在短期內累積的氣溶膠化擴增產物就會污染實驗室中的試劑、儀器設備和通風系統，造成嚴重的實驗室污染，導致檢驗樣本出現假陽性結果，使臨床做出錯誤的判斷和決策，進而引發后續一系列的事故和恐慌。
①臨床標本中存在的大量待測微生物或待測靶核酸
②科研中得到的質粒
③以前分析研究的特定微生物或靶核酸
④大量存在于實驗環境中的特定微生物或靶核酸
⑤以前擴增產物的殘留污染,這也是 PCR 實驗室產生的將造成假陽性的“污染”。
PCR擴增可以引起實驗室中擴增產物的累積,通常一次典型的PCR
擴增可以產生109拷貝的靶序列,如果氣溶膠化,甚至的氣溶膠都會含有106拷貝的擴增產物。如果不加以控制,在短期內累積的氣溶膠化的擴增產物即會污染實驗室中的試劑、儀器設備和通風系統,從而造成嚴重的實驗室“污染”,出現大量的假陽性結果。
PCR實驗室應相對獨立，盡量避免與其他普通實驗套疊或者有通道上的交叉。看過一個圖，他們的PCR實驗室設置在檢驗科的里面，醫廢和標本的運送要穿過檢驗科的整個走廊，這種情況、物流、污物均在同一個通道，風險較高，應盡量避免。
設置區域：
PCR實驗室應設置以下區域：試劑儲存和準備區、標本制備區、擴增區、擴增產物分析區。這個4個區域在物理空間上必須完全獨立，各區域無論是空間上還是在使用中，應當始終處于完全的分割狀態，不能有空氣的直接相通。根據使用儀器的功能，區域可以適當合并。每個區域間設置傳遞窗，要求一側打開時另一側無法打開。4個區域應設置獨立的緩沖間，應設置可以通到四個操作區域的PCR走廊，在進入各區域前，應設置更衣間，每個區域的衣服可用不同顏色進行區分，在清潔區應設置洗澡間、衛生間、值班室。還應考慮到醫廢和標本的運送通道。
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