1、清理廢液缸并且對廢液缸用有效氯含量為 2000mg/L 消毒水浸泡消除核酸污染；
2、用有效氯含量為 2000mg/L 消毒水對移液進行擦洗，關鍵部位為移液前端易污染部位，清潔干凈后用潔凈水再擦拭一遍；
3、將離心管架、擴增管架、擴增管架底板、吸嘴盒及其他相關物品用有效氯含量為 500mg/L 的消毒水浸泡 2 小時后，用清水沖洗干凈晾干后使用；
4、對污染區域內的設備如擴增儀、全自動提取儀等，使用核酸氣溶膠污染清除劑進行反復處理；對生物安全柜等含有空氣過濾系統的設備，需更換過濾網；
5、用有效氯含量為 500mg/L 的消毒液對整個實驗室（地板、墻面、天花板、門、窗戶等地方）進行清潔，并且用用有效氯含量為 1000mg/L的消毒水對實驗室進行噴霧消毒(重點部位為操作區)，有效降解空氣中的氣溶膠與附著在實驗臺表面的核酸污染；同時加大通風量（內循環無用，盡可能外循環）；
6、待污染區域及設備器件清理完成后，常用設備和操作臺面使用移動紫外消毒車近距離輻照1小時；實驗室內則使用室內紫外燈整晚輻照。
步驟1- 6 必須堅持每天進行，確保消除實驗室污染；
PCR擴增檢驗實驗室原則上分為四個單獨的工作區域：試劑貯存和準備區、標本制備區、擴增反應混合物配制和擴增區、擴增產物分析區。為避免交叉污染，進入各個工作區域必須嚴格遵循單一方向進行，即只能從試劑貯存和準備區→標本制備區→擴增反應混合物配制和擴增區→擴增產物分析區。 各實驗區之間的試劑及樣品傳遞應通過傳遞窗進行。
臨床PCR實驗室設計的“16字口訣”：各區獨立、注意風向、因地制宜、方便工作。
(1)在物理空間上，必須是完全相互獨立的，各 區域無論是在空閑還是在使用中，應始終處于 完全的分隔狀態; (2)不能有空氣的直接相通。
墻面：主體結構建議使用彩鋼板圍護，墻面光潔、不產塵積塵、耐腐蝕，易清潔、無縫隙；
地面：建議使用PVC卷材，、耐腐蝕、無縫隙、無滲漏；
陰陽角：均采用圓弧角密封處理，不易積塵；
傳遞窗：必須設置互鎖(機械或電子)；
主入口：實驗室主入口設有門禁管理；
通風系統：避免交叉污染；
排風系統：宜設置過濾器凈化；
氣流組織：采用上送下排形式；
壓力梯度：壓力梯度控制通過微壓差計及精密自控系統控制；
排水系統：排水系統應不滲漏，下水應有防回流設計。
應急用電：應有緊急發電設備或雙回路供電。關鍵設備應配備足夠的UPS并接入設備。
防護設施：設置洗眼裝置，必要時應有應急噴淋裝置；設置非接觸式操作理念(感應式水、感應式自動門、互鎖傳遞窗等)。
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