根據實驗室的具體情況編寫質量體系文件，《質量手冊》、《程序文件》、《作業指導書》，并保證管理體系運行有效。
管理體系的特點是應有明確的目的、規范的管理、有效的制約、的機制、能自我發展的整體。
建立完善的SOP文件，對完成各項質量活動的方法作出規定，每個SOP都應對一個或一組相互關系的活動進行描述。
每個SOP文件應說明該項質量各環節的輸入、轉換和輸出所需的文件、物資、人員、記錄以及它們與有關活動的接口關系。
明確每個環節轉換過程中各項因素的要求，即由誰做、做什么、做到什么程序、達到什么要求，如何控制、形成什么記錄和報告，以及相應的審批手續。
規定在質量活動中需要注意的例外或特殊情況的糾正措施。SOP應簡練、明確和易懂并且工作人員熟練掌握和嚴格遵守。
PCR實驗室并沒有嚴格的凈化要求，但是為了避免各個實驗區域間的可能性，通風方式應為機械通風，不應自然通風，且不宜使用循環風。同時要嚴格控制送、排風比例以保證各試驗區的壓力要求。PCR實驗室的空氣流向應按照試劑儲存和準備區→標本制備區→擴增區→擴增產物分析區進行，防止擴增的產物順空氣氣流進入擴增前的區域。可選擇負壓排風裝置，區域相對于相鄰區域壓不小于-10Pa。也可通過安裝排氣扇或者其他方式實現。PCR實驗室要求溫度18~26℃，相對濕度30%~70%。
1.實驗室空調通風系統設計及壓力控制
PCR實驗室并沒有嚴格的凈化要求，但是為避免各個實驗區域間交叉污染的可能性，宜采用全送全排的氣流組織形式。同時，要嚴格控制送、排風的比例以保證各實驗區的壓力要求。
2.污染的預防與控制
PCR實驗室設計的問題是如何避免污染。在實際工作中，常見的有以下幾種污染類型：擴增產物的污染；天然基因組DNA的污染；試劑的污染以及標本間的污染。由于一旦發生污染，實驗就必須停止，直到找到污染源為止，而且實驗結果必須作廢，需重新進行實驗。所以發生污染后再圍繞實驗室來尋找污染源不但耗時而且繁瑣，浪費人力物力。因此要避免污染，首先應是預防，而不是排除。
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